OBJECTIF GÉNÉRAL : connaître les principales méthodes et les principaux outils d’analyse de données RNAseq de novo ou avec génomes de référence.
OBJECTIFS OPÉRATIONNELS : UTILISER LES OUTILS D’ANALYSE DE DONNÉES RNASEQ DANS L’ENVIRONNEMENT GALAXY :
- Évaluer la qualité du jeu de données brutes,
- mettre en place des stratégies de nettoyage du jeu de données,
- assembler un jeu de données de novo et/ou remapper les jeux de données sur un génomes / transcriptome de référence,
- annoter un transcriptome,
- identifier les gènes différentiellement exprimés.