Cette prestation permet aux utilisateurs de faire l'analyse de fragments eux-mêmes (ex : T-RFLP, ARISA, Microsatellites) sur le séquenceur 3130XL . Elle inclut les consommables et la maintenance du séquenceur. Selon l'application, des aliquots d'amorces marquées, des enzymes de l'ADN polymérase, des enzymes de restriction, des kits de purification et des marqueurs de taille sont disponibles et facturés séparément .
Séquençage et biologie moléculaire
EMBRC-France met à votre disposition les outils nécessaires pour mener à bien des projets de séquençage et/ou de génotypage. La plateforme est organisée en deux sites : Plateforme Genomer à la Station Biologique de Roscoff , Plateforme BIO2MAR à l'Observatoire Océanologique de Banyuls-sur-mer.
Expertise
- Préparations de banques
- Séquençage
- Génotypage
- Manipulations d’automatisation
Services associés (bioinformatique)
- Prétraitement des données
- Assemblage
- Recherche de similarités
- Annotation
- Traitement bio-informatique des données
Offre de service
Il existe plusieurs types d’accès au service : accès autonome, accès avec accompagnement ou service à distance.
Implication dans des réseaux et des infrastructures
- Biogenouest
- Bio2Mar
Labellisation et certification
Roscoff : labellisé IBISA, et certifié ISO 9001
Accès aux services
Il existe 3 types d’accès aux services d’EMBRC France
l’accueil scientifique, l’accueil pédagogique, l’accès à distance.
Merci de remplir votre panier en sélectionnant le type d'accès qui correspond à votre demande. Sur les prestations ci-dessous seuls les types d'accès proposés pour la prestation sont indiqués et peuvent être ajoutés à votre panier.
En savoir plus sur les spécificités des 3 types d'accès.
Prestations
Analyse de fragments sur le séquenceur 3130XL
Prestation :
Analyse par des utilisateurs autorisés (formés par le personnel de la plateforme)
Services :
Sites :
Mise à disposition d'équipements
Prestation :
Services :
Sites :
Accompagnement pour l’utilisation et mise à disposition de :
- Miseq
- Séquenceur capillaires (3130xl-Life technologies)
- Bioanalyzer
- Covaris
- Qubit
- Labchip GXt
- PCR quantitative (Lightcycler480-Roche)
Mise à disposition d'équipements
Prestation :
Services :
Sites :
- Mise à disposition de lecteur microplaque après formation par le personnel de la plateforme
- Utilisation de la machine StepOne plus qPCR par les utilisateurs autorisés (formés par le personnel de la plateforme).
- Utilisation du Biomek 3000 par les utilisateurs autorisés (formés par le personnel de la plateforme)
- Mise à disposition du séquenceur ABI310 pour Analyse SSCP : permet aux utilisateurs autorisés (formés par le personnel de la plateforme) de réaliser eux-mêmes l'analyse SSCP sur le séquenceur ABI310. Elle inclut le formamide, les marqueurs de taille, les consommables et la maintenance du séquenceur.
- Mise à disposition du séquenceur Sanger 3130 : permet aux utilisateurs autorisés (formés par le personnel de la plateforme) d'effectuer eux-mêmes le séquençage Sanger sur le séquenceur 3130XL
- Utilisation de l'ultracentrifuge OPTIMA MAX XP avec le rotor TL-100 par les utilisateurs autorisés (formés par le personnel de la plate-forme).
Purification du produit PCR
Prestation :
Cette prestation comprend la purification du produit PCR réalisée par le personnel de la plateforme et inclut les consommables et le kit de purification.
Services :
Sites :
Séquençage
Prestation :
Séquençage Sanger effectué par le personnel de la plateforme
Services :
Sites :
Cette prestation comprend le séquençage Sanger effectué par le personnel de la plateforme sur l'ADN purifié (ex. produits de PCR purifiés, l'ADN plasmidique). Il comprend les réactifs de séquençage de cycle (kit BigDye Terminator), le kit de purification, les consommables de séquenceur et de maintenance du séquenceur. Des amorces universelles sont fournies, les amorces de séquençage autrement spécifiques doivent être fournies avec l'échantillon d'ADN par le client. Cette prestation peut être combinée avec la prestation de purification de produit PCR pour les produits PCR non-purifiés.
Sequencing
Prestation :
Services :
Sites :
- Banks preparations
- Sequencing with MiSeq (Illumina)