Spectrométrie de masse

Nos équipes et équipements permettent de réaliser des études par spectrométrie de masse, depuis l’atome jusqu’à la macromolécule. Les analyses métabolomiques peuvent être ciblées ou non-ciblées. Ces analyses s’appuient sur les standards internes ou sur les bibliothèques internationales.


La plateforme est organisée sur un site :

  • Plateforme MétaboMER à Roscoff

Expertise

  • Mesure de la masse de composés biologiques
  • Identification de métabolites
  • Quantification

Le plateau MétaboMER réunit sur le site de Roscoff des équipements scientifiques de spectrométrie de masse pour des investigations du métabolisme à travers la caractérisation de petites molécules et de macromolécules. La spécificité de son offre repose sur une spécialisation sur des matrices d’origine marine et son engagement dans le développement de la métabolomique marine.

Composante labellisée de la plate-forme CORSAIRE de Biogenouest, il s’appuie aussi sur les autres plateaux techniques du site de Roscoff (bio-informatique, génomique, cristallographie des protéines et imagerie).

Le plateau est ouvert à la communauté scientifique, publique et privée, dédiée principalement à l’étude des organismes et des écosystèmes marins. Il est aussi disponible à d’autres collaborations dans ses domaines d’expertise.

Notre plateau a pour vocation de devenir un centre de collaboration identifié et visible au niveau régional (GIS Europôle Mer, Pôles de Compétitivité Mer-Bretagne et Valorial, Axe4 Biogenouest, groupe LIPIDOMOUEST), national (Réseau Français de Métabolomique et de Fluxomique, IBISA, projets IDEALG, EMBRC France, Oceanomics, LabexMER) et international (ASSEMBLE I3, ESFRI EMBRC, UMI CNRS-PUC Chili et GDRI). 

Offre de service

  • Prestation de service
  • Projet à long terme

Les compétences analytiques développées au sein d’EMBRC France permettent de proposer des analyses approfondies, qualitatives ou quantitatives, sur une très large gamme de famille de molécules extraites de matrices biologiques d’origines diversifiées (animale, végétale, microbienne) : algues, cultures cellulaires, filtres, sédiments, matière particulaire, eau de mer, tissus...

La plateforme réalise des prestations de service ponctuelles ou des études dans le cadre d’un projet scientifique à long terme nécessitant un nombre conséquent d’analyses.

Principaux équipements

  • Automate SPE (Solid Phase Extraction)
  • UHPLC (Ultra-high performance liquid chromatography)
  • Spectromètre de masse LTQ Orbitrap
  • SFC (Supercritical Fluid Chromatography)
  • Spectromètre de masse QTof
  • Thermo-Désorbeur (couplé à la GC MS)
  • GC (Gas chromatography)
  • Spectromètre de masse simple Quad

Implication dans des réseaux et des infrastructures

Biogenouest
Réseau Grand-Ouest de Métabolomique Corsaire

Labellisation

Plate-forme CORSAIRE de Biogenouest
Démarque en cours pour la norme ISO9001:2008

Prestations

Métabolomique

Prestation :
Services :
Spectrométrie de masse
Sites :
Roscoff

Préparation d'échantillons à la demande : 

  • Extraction des métabolites d'un échantillon à partir de poudre lyophilisée
  • Passage automatisé sur Autotrace de Dionex d'échantillons. Extraction ou purification par SPE.
  • Dérivation des métabolites pour l'analyse en chromatographie en phase gazeuse

Analyses :

  • Analyse d’échantillons par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse.
  • Analyse d’échantillons en chromatographie liquide ultra haute performance couplée à la spectrométrie de masse haute résolution.
  • Analyse d’échantillons en chromatographie en phase supercritique couplée à la spectrométrie de masse haute résolution.
  • Analyse d’échantillons en chromatographie liquide ultra haute performance couplée à la détection UV.
  • Thermodésorption d'échantillons adsorbés sur barreaux SBSE et couplage au GC/MS.
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