Le FlowCAM  (Fluid imaging Inc.) est un système d’imagerie pour la mesure et la classification d'organismes et de particules (de 20 à 200 µm) présents dans un milieu liquide. Il est adapté pour les organismes de type nano- et micro-plancton qui peuvent être vivants ou fixés.

Le protocole « Analyses sans classification taxonomique » (#1) comprend :

- La réception et le colisage retour (dans le cas où l’analyse est faite par un expert de la plateforme),
- La préparation du projet et sa maintenance,
- L’analyse des échantillons par l’instrument (FlowCAM : analyse + process + extraction des images + reconditionnement et ZooScan : analyse + process + séparation sur image + extraction des images + reconditionnement),
- L’hébergement des images sur Ecotaxa,
- Une formation initiale à l’instrument (dans le cas où l’analyse est faite par un personnel externe hébergé).

Le protocole « Analyses avec classification taxonomique < 20 taxa » (#2) comprend :

- Protocol #1 (Analyses sans classification taxonomique),
- Une formation complète à l’instrument et au logiciel Ecotaxa (dans le cas où l’analyse est faite par un personnel externe hébergé),
- Une formation à la taxonomie du plancton sur imagerie (facultatif selon niveau de l’opérateur),
- La validation des images sur 20 groupes taxonomiques sur Ecotaxa (liste définie avec l’utilisateur).

Le protocole « Analyses avec classification taxonomique > 20 taxa » comprend :

Protocol #2 (« Analyses avec classification taxonomique < 20 taxa ») +
La validation des images sur plus de 20 groupes taxonomiques sur Ecotaxa (liste définie avec l’utilisateur)